對(duì)于一般的底部過(guò)濾，水流經(jīng)較小區(qū)域的礫石頂部，礫石層之間的空間更寬敞。低于一層的每一層礫石的面積和空間變得更大且更寬敞。這種設(shè)計(jì)安排是為了提供更大的表面積并減慢淤積速度。如果底層太淤，則需要從相反方向過(guò)濾水流。該設(shè)備的范圍向后噴灑，因此大部分雜質(zhì)將被沖洗掉。

底部過(guò)濾器是基于此概念而制成的。將足夠厚的礫石放在多孔的塑料板上，水將通過(guò)塑料板后面的立管從板下方排出。塑料板下面的水流立即被流過(guò)礫石層的水代替。同時(shí)，氮化物細(xì)菌也開(kāi)始聚集在大部分礫石層上。結(jié)果，水中的細(xì)菌數(shù)量足以進(jìn)行生物過(guò)濾過(guò)程。

潛水泵廠家為了確保足夠的水流，將氣石裝置放置在立管的底部，以形成氣泡水流，將水推到地面。當(dāng)氣石和氣泵產(chǎn)生大量氣泡時(shí)，流經(jīng)底部過(guò)濾器的水足以滿足細(xì)菌的應(yīng)用。但是，長(zhǎng)期使用后，氣石裝置會(huì)堵塞許多雜質(zhì)，極大地影響性能。同時(shí)，氣泵的壓力也增加，導(dǎo)致水和氣泡的流動(dòng)減慢，這降低了生物過(guò)濾的效率。

氣石的替代品是潛水泵，它只是一個(gè)裝在密封塑料蓋中的小型電動(dòng)機(jī)。將其安裝在上升管的頂部時(shí)，水將通過(guò)螺旋槳的旋轉(zhuǎn)而被吸到管中。除了定期清潔潛水泵的螺旋槳翼上的雜質(zhì)外，不需要采取其他維護(hù)措施。為了減少雜質(zhì)在礫石層上的積聚并影響水流量，一些水族館愛(ài)好者會(huì)逆轉(zhuǎn)底部過(guò)濾器的水流量。從底層過(guò)濾出的水流經(jīng)立管，然后進(jìn)入濾板的底部，然后在礫石層范圍內(nèi)上升。最常用的反向水流操作方法是使用帶有連接裝置的潛水泵。因此，水流可以先通過(guò)一個(gè)小的海綿過(guò)濾器，然后進(jìn)入潛水泵，然后向下推入立管。但是，必須清潔海綿，以確保沒(méi)有雜質(zhì)使水暢通無(wú)阻。另外，一些魚(yú)友選擇外部筒式過(guò)濾器與底部過(guò)濾器配合以產(chǎn)生倒流性能。但是，由于該設(shè)備的外部盒式過(guò)濾器既費(fèi)時(shí)又費(fèi)力，并且泵體內(nèi)的水流會(huì)引起摩擦，這將嚴(yán)重影響外部盒式過(guò)濾器。設(shè)備的正常流速。因此，使用潛水泵作為動(dòng)力源是最有效的。